In opdracht van de Nederlandse overheid treedt Nidos op als voogd voor alleenstaande minderjarige vluchtelingen en zet zich voor hen in. Jeugdbeschermers van Nidos voeren de voogdijtaken uit. Het centrale kantoor is gevestigd in Utrecht. De jeugdbeschermers werken vanuit regiokantoren verspreid door heel Nederland. Nidos heeft niet zelf de dagelijkse zorg over de minderjarigen.
Nidos is wettelijk vertegenwoordiger van de jongeren en beschermt als zodanig hun rechten. De jeugdbeschermer begeleidt de jongere totdat deze de leeftijd van 18 jaar heeft bereikt of tot het moment dat hij of zij terugkeert naar het land van herkomst.